Koronavirusi su RNA virusi pripada obitelji coronaviridae. ove virusi pokazuju izrazito visoke stope pogrešaka tijekom replikacije zbog nedostatka lektorske nukleazne aktivnosti njihovih polimeraza. U drugim organizmima, pogreške replikacije se ispravljaju, ali koronavirusi nemaju tu sposobnost. Kao rezultat toga, pogreške replikacije u koronavirusima ostaju neispravljene i akumuliraju se, što zauzvrat djeluje kao izvor varijacija i prilagodbi u ovim virusi. Dakle, oduvijek je bila priroda stvari da se koronavirusi podvrgavaju mutaciji u svojim genomima iznimno visokim stopama; više prijenosa, događa se više pogrešaka replikacije, a time i više mutacija u genomu što dovodi do više varijante posljedično.
Očito, mijenjanje u novo varijante nije novo za koronaviruse, ljudski koronaviruse gradili su mutacije u nove oblike u novijoj povijesti. Bilo ih je nekoliko varijante odgovoran za razne epidemije od 1966. godine, kada je snimljena prva epizoda.
SARS-CoV je bila prva smrtonosna varijanta koja je uzrokovala koronavirusa epidemija u provinciji Guangdong u Kini 2002. MERS-CoV je bila sljedeća važna varijanta koja je izazvala epidemiju u Saudijskoj Arabiji 2012. godine.
Roman koronavirusa SARS-CoV-2, varijanta odgovorna za trenutačnu pandemiju COVID-19 koja je započela u prosincu 2019. u Wuhanu u Kini, a potom se proširila svijetom i postala prva koronavirusa pandemije u ljudskoj povijesti, kontinuirano je prolazio daljnju prilagodbu akumulirajući mutacije u različitim geografskim regijama što je dovelo do nekoliko pod-varijante. Ovi pod-varijante imaju male razlike u svom genomu i šiljastim proteinima i pokazuju razlike u brzini prijenosa, virulenciji i infektivnosti imunološkog bijega.
Na temelju prijetnje koju ove podvarijante predstavljaju, grupirane su u tri kategorije – Varijante zabrinjavajuće (VOC), Varijante od interesa ili Varijante pod istragom (VOI) i Varijante pod nadzorom. Ovo grupiranje podvarijanti temelji se na dokazima koji se odnose na prenosivost, imunitet i težinu infekcije.
- Varijante zabrinutosti (VOC)
Varijante koje izazivaju zabrinutost (VOC) imaju jasnu povezanost s povećanjem prenosivosti ili virulencije ili smanjenjem učinkovitosti bilo koje javnozdravstvene mjere kao što je učinkovitost cjepiva koja se trenutno koriste.
Oznaka WHO | Loze | Prvi put otkrivena zemlja (zajednica) | Prvi put otkriveni godina i mjesec |
Alfa | B.1.1.7 | Ujedinjeno Kraljevstvo | rujna 2020 |
Beta | B.1.351 | Južna Afrika | rujna 2020 |
Gama | P.1 | Brazil | prosinca 2020 |
Delta | B.1.617.2 | Indija | prosinca 2020 |
- Varijante od interesa ili Varijante pod istragom (VOI)
Poznato je da interesne varijante ili varijante pod istragom (VOI) imaju genetske promjene koje mogu utjecati na njihovu prenosivost, virulentnost ili učinkovitost mjera javnog zdravlja i identificirano je da uzrokuju značajan prijenos u zajednici.
Oznaka WHO | Loze | Prvi put otkrivena zemlja (zajednica) | Prvi put otkriveni godina i mjesec |
Eta | B.1.525 | Nigerija | prosinca 2020 |
Jota | B.1.526 | SAD | studenog 2020 |
deseto slovo grčkog alfabeta | B.1.617.1 | Indija | prosinca 2020 |
Lambda | C.37 | Peru | prosinca 2020 |
- Varijante pod nadzorom
Varijante pod nadzorom detektiraju se kao signali i postoje naznake da mogu imati svojstva slična VOC-u, ali dokazi mogu biti slabi. Stoga se ove varijante stalno nadziru za bilo kakvu promjenu.
Oznaka WHO | Loze | Prvi put otkrivena zemlja (zajednica) | Prvi put otkriveni godina i mjesec |
B.1.617.3 | Indija | veljače 2021 | |
A.23.1+E484K | Ujedinjeno Kraljevstvo | prosinca 2020 | |
Lambda | C.37 | Peru | prosinca 2020 |
B.1.351+P384L | Južna Afrika | prosinca 2020 | |
B.1.1.7+L452R | Ujedinjeno Kraljevstvo | siječnja 2021 | |
B.1.1.7+S494P | Ujedinjeno Kraljevstvo | siječnja 2021 | |
C.36+L452R | Egipat | prosinca 2020 | |
AT.1 | Rusija | siječnja 2021 | |
Jota | B.1.526 | SAD | prosinca 2020 |
Zeta | P.2 | Brazil | siječnja 2021 |
AV.1 | Ujedinjeno Kraljevstvo | ožujak 2021 | |
P.1+P681H | Italy | veljače 2021 | |
B.1.671.2 + K417N | Ujedinjeno Kraljevstvo | lipnja 2021 |
Ovo grupiranje je dinamičko, što znači da se podvarijante mogu ukloniti iz jedne skupine ili uključiti u bilo koju skupinu ovisno o promjeni procjene prijetnji u smislu prenosivosti, imuniteta i težine infekcije.
Ironično, čini se da je evolucija SAR-CoV-2 u tijeku. Idući po prirodi ovoga virus, sve dok postoji prijenos među ljudima, bit će grešaka u replikaciji i mutacija. Neki mutant ili varijanta mogu nadvladati selekcijski pritisak da postanu zarazniji i virulentniji ili izbjeći imunološki odgovor kako bi cjepivo postalo manje učinkovito. Moguće je da će mnogo više varijanti biti otkriveno u dogledno vrijeme u regijama veće transmisije. Svođenje prijenosa na najmanju moguću mjeru i stalno praćenje ključni su za strategije zadržavanja.
***
Izvori:
- Prasad U., 2021. Novi sojevi SARS-CoV-2 ( virus odgovoran za COVID-19): Može li pristup 'neutralizirajućih protutijela' biti odgovor na brzu mutaciju? Znanstveni europski. Objavljeno 23. prosinca 2020. Dostupno online na http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/
- SZO, 2021. Praćenje varijanti SARS-CoV-2. Dostupno online na https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ECDPC 2021. Zabrinjavajuće varijante SARS-CoV-2 od 8. srpnja 2021. Dostupno online na https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
***