SARS-CoV-2: Koliko je ozbiljna varijanta B.1.1.529, sada nazvana Omicron

Varijanta B.1.1.529 prvi put je prijavljena SZO-u iz Južne Afrike 24^th studenog 2021. Prva poznata potvrđena infekcija B.1.1.529 bila je iz uzorka prikupljenog 9.^th studenog 2021¹. Drugi izvor² ukazuje da je ova varijanta prvi put otkrivena u uzorcima prikupljenim 11^th studenog 2021. u Bocvani i 14^th studenog 2021. u Južnoj Africi. Od tada se broj slučajeva COVID-19 naglo povećao u gotovo svim provincijama u Južnoj Africi. Kao i 27^th studenog 2021., novi slučajevi ove varijante također su prijavljeni u Belgiji, Hong Kongu, Izraelu, Ujedinjenom Kraljevstvu³, Njemačku, Italiju i Češku Republiku koje su sve povezane s podrijetlom.  

Hvala južnoafričkim vlastima što nisu odvojile vrijeme za komuniciranje i dijeljenje relevantnih informacija s globalnom znanstvenom zajednicom kako bi se skupina stručnjaka SZO-a mogla sastati 26.^th studenog 2021. i brzo označite ovu varijantu kao varijantu koja izaziva zabrinutost (VOC). Ozbiljnost stvari mogla bi se procijeniti iz činjenice da je B.1.1.529 označena varijantom pod nadzorom (VUM) prije samo dva dana, 24.^th studenog 2021. prije nego što je 26. označen kao VOC^th studenoga 2021., a da nije prva označena kao varijanta pod istragom (VOI).  

Tablica: Zabrinjavajuće varijante SARS-CoV-2 (VOC) na dan 26. studenog 2021. 

Hitnost označavanja B.1.1.529 kao varijante koja izaziva zabrinutost (VOC) bila je opravdana jer je utvrđeno da je ova varijanta najdivergentnija varijanta SARS-CoV-2 do sada. U usporedbi s virusom SARS-CoV-2 koji je izvorno otkriven u Wuhanu u Kini, ovaj ima čak 30 promjena aminokiselina, 3 male delecije i 1 malu inserciju u proteinu šiljka. Od ovih promjena, 15 se nalazi u domeni za vezanje receptora (RBD), dijelu virusa koji mu omogućuje ulazak u ljudske stanice, što dovodi do infekcije. Ova varijanta također ima niz promjena i brisanja u drugim genomskim regijama². Mutacije su toliko opsežne da bi se moglo nazvati novim sojem, umjesto varijantom. Nevjerojatno velika količina šiljastih mutacija znači povećanu mogućnost bijega od poznatih antitijela što ovu varijantu čini ozbiljnom zabrinjavajućom⁵.  

Promjena na nove varijante uobičajena je za koronaviruse. Oduvijek je bila priroda stvari da koronavirusi prolaze kroz mutaciju u svojim genomima iznimno visokim stopama, zbog nedostatka lektorske nukleazne aktivnosti njihovih polimeraza; što je više prijenosa, više je grešaka u replikaciji i stoga se više mutacija nakuplja u genomu, što dovodi do novih varijanti. Ljudski koronavirusi stvaraju mutacije kako bi stvorili nove varijante u novijoj povijesti. Bilo je nekoliko varijanti odgovornih za epidemije od 1966. godine, kada je snimljena prva epizoda⁶. Ali zašto tako opsežna mutacija u jednom naletu? Možda, jer se varijanta B.1.1.529 razvila tijekom kronične infekcije imunokompromitirane osobe, vjerojatno neliječenog bolesnika s HIV/AIDS-om⁷.  

Što god mogao biti uzrok opsežnih mutacija, ako je brza brzina kojom se proširila u Južnoj Africi bilo koji pokazatelj, evolucija ove varijante može imati ogroman utjecaj na imunitet, prenosivost i virulenciju i učinkovitost postojećih cjepiva, koja se trenutno koriste.  

Hoće li postojeća cjepiva ostati učinkovita protiv ove nove varijante ili će biti više slučajeva probojnih infekcija cjepiva, trenutno je malo dostupnih podataka da bi se izvukao bilo kakav zaključak. Međutim, u nedavnoj studiji, sintetička varijanta s 20 mutacija u spike proteinu pokazala je gotovo potpuni bijeg od antitijela⁷. To ukazuje da nova varijanta B.1.1.529 s daleko povećanim mutacijama može pokazati značajno smanjenu neutralizaciju antitijelima. Međutim, čini se da je nova varijanta prenosiva zahvaljujući brzoj brzini kojom je zamijenila varijantu Delta u Južnoj Africi, iako trenutni podaci nisu dovoljno prikladni da bi se napravila ikakva pouzdana procjena. Slično, nije moguće komentirati ozbiljnost simptoma u ovoj fazi.  

S obzirom na činjenicu da Europa već ima neuobičajeno velik broj slučajeva COVID-19 (zbog visoko prenosive delta varijante) u posljednjih nekoliko tjedana i brzu stopu kojom se omikron (B.1.1.529) varijanta se proširila u Južnoj Africi koja je nedavno zamijenila delta varijantu, nekoliko zemalja u Europi uključujući Veliku Britaniju, Njemačku i Italiju nametnulo je ograničenja putovanja za dolaske iz Južne Afrike i iz susjednih zemalja poput Bocvane, Malavija, Mozambika, Zambije i Angola. U strahu od najgoreg, Izrael će zabraniti ulazak posjetiteljima iz svih zemalja.  

Svijet je toliko uložio u razvoj i primjenu cjepiva protiv COVID-19 kako bi zaštitio ljude od pandemije. Pitanje koje je najviše u svijesti znanstvenika i nadležnih jest hoće li glavna cjepiva protiv COVID-19 kao što su Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson ostati učinkovita i protiv Omicron (B.1.1.529) varijante . Tome potiče činjenica da su u Južnoj Africi zabilježene prodorne infekcije. Dva slučaja iz Hong Konga također su primila doze cjepiva⁹. 

Razvoj "pan-koronavirusnih" cjepiva¹⁰ (platforme multivalentnih cjepiva¹¹) čini se da je potreba sata. No, brže, možda će biti moguće brzo proizvesti dodatne doze mRNA i DNK cjepiva koje pokrivaju mutacije. Osim toga, nedavno odobren antivirusni lijekovi (Merckov Molnupiravir i Pfizerov Paxlovid) trebali bi biti korisni u zaštiti ljudi od hospitalizacije i smrti.   

 *** 

Reference:  

1. SZO 2021. Vijesti – Klasifikacija Omikrona (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern. Objavljeno 26. studenog 2021. Dostupno na adresi https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Europski centar za prevenciju i kontrolu bolesti. Posljedice pojave i širenja SARSCoV-2 B.1.1. 529 varijanta zabrinutosti (Omicron), za EU/EEA. 26. studenog 2021. ECDC: Stockholm; 2021. Dostupno na Internetu na adresi https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. Vlada UK-a 2021. Priopćenje za javnost – Identificirani prvi slučajevi varijante Omicron u UK-u. Objavljeno 27. studenog 2021. Dostupno na https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. SZO, 2021. Praćenje varijanti SARS-CoV-2. Dostupno online na https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: B.1.1 potomak povezan s južnom Afrikom s velikim brojem Spike mutacija #343. Dostupno online na https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Varijante koronavirusa: što znamo do sada. Znanstveni europski. Objavljeno 12. srpnja 2021. Dostupno na adresi http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Djelovanje cjepiva – Što znamo o novoj varijanti koronavirusa B.1.1.529 i trebamo li biti zabrinuti? Dostupno u https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. i sur. Visoka genetska barijera za bijeg poliklonskih neutralizirajućih antitijela SARS-CoV-2. Priroda (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Jako mutirana varijanta koronavirusa stavlja znanstvenike na oprez. Priroda Novce. Ažurirano 27. studenog 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. “Pan-coronavirus” cjepiva: RNA polimeraza se pojavljuje kao cilj cjepiva. Znanstveni europski. Objavljeno 16. studenog 2021. Dostupno na http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Priopćenje za vijesti – NIAID izdaje nove nagrade za financiranje "pan-koronavirusnih" cjepiva. Objavljeno 28. rujna 2021. Dostupno na https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***